Advanced Practical Bioinformatics Course ｀KYOTEN¨ FY 2021~Zoomを聞喘したオンラインvxのお岑らせ~
2021.11.18
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- 冩梢
- 匳粗
Advanced Practical Bioinformatics Course ｀KYOTEN¨ FY 2021~Zoomを聞喘したオンラインvxのお岑らせ~
これまで凍ってきた、光嶽オミックスやバイオインフォマティクスの盾裂譜姥と室宝を麿寄僥?冩梢侭?巷望に戻工し、凖思唹k嶽酉冩梢にvする匳僥冩梢を容序しています。
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書指のバイオインフォマティクス(京鴛)鹿嶄トレ`ニングコ`スは、貧雫宀鬚韻離轡鵐哀襯札襯禰`タ盾裂です。
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云僥バイオインフォマティクス盾裂片のJordan Ramilowski彈縮娩がvを佞瓠
オンラインでの哂囂によるコ`スを畠４指の晩殻で綜才４定１埖17晩から蝕岸いたします。
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歌紗継
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ご歌紗を錬李される圭は、和芝雨檎晦よりお賦zみください。
☆歌紗辛倦や輝晩のオンライン秤烏については艶余倖艶にご銭大いたします。
FY2021 KYOTEN “Advanced Bioinformatics Practical Course” will cover single cell data analysis in R 4.1 (RStudio, Seurat 4, Monocle 3). The course will be held online (Zoom) and will be given in English.
Participation in the course requires:
(i) basic familiarity with R / RStudio
(ii) basic understanding of RNA-seq single cell technology
(iii) setting up own computational environment
(instructions are provided)
General Course Info
＊ Format & Language
Zoom / English
＊ Fees
醍狭郊利 students: Free
醍狭郊利 researchers: 5,000 yen
External students collaborating at 醍狭郊利 KYOTEN: Free
External researchers collaborating at 醍狭郊利 KYOTEN: 5,000 yen
Other external researchers: 7,500 yen
＊ Number of Participants
20 participants (maximum)
(priority will be given to Kyoten collaborators)
＊ Application form
Please complete the online Application Form.
＊ Application deadline
24 December, 2021
＊ Instructor
Jordan Ramilowski, PhD (醍狭郊利/)
＊ Lectures
4 classes for 2 hours/each, 8 hours total
Each class has lecture and practical
Lecture 1: 17 January, 2022, 17:30–19:30
Working with own and public single cell data. Creating and understanding Seurat object
Lecture 2: 31 January, 2022, 17:30–19:30
scRNA-seq data processing in Seurat: QC, normalization, clustering and annotations
Lecture 3: 14 February, 2022, 17:30–19:30
scRNA-seq data integration & differential expression in Seurat
Lecture 4: 28 February, 2022, 17:30–19:30
Introduction to scRNA-seq trajectory analysis using Monocle 3
For more details please refer to:
お諒い栽わせ枠