文部科学省共同利用?共同研究拠点「マルチオミックスによる遗伝子発现制御の先端的医学共同研究拠点」共同利用のお知らせ
- TOPICS
- 研究
- 医疗
共同利用シングル搁狈础-蝉别辩(受託解析)のお知らせ
受付期间:2021年8月词11月(学外は10月まで)
解析终了后にデータ纳品します。
受注件数:各月１件程度(検体数は応相谈)
概要
?解析方法:10X Genomics社Chromiumを用いた3’ mRNA シングルセルRNA-seq解析
?対象生物种:ヒト、マウス
?
?シーケンス条件:?10,000细胞、约20,000リード/细胞
?データ一次解析:10X Genomics社Cell rangerによるゲノムマッピング、遗伝子発现量计算
?受付可能な検体:冻结细胞、または生细胞(学内のみ可)
?费用
&濒迟;学内&驳迟;
通常価格:465,000円/検体、急ぎ価格:650,000円/検体
※11月受付分は、急ぎ価格のみ
&濒迟;学外&驳迟;
通常価格:580,000円/検体、急ぎ価格:790,000円/検体
※10月受付分は、急ぎ価格のみ
?纳期の目安
通常価格:検体受け取り后、约２ヶ月
急ぎ価格:検体受け取り后、约１ヶ月&苍产蝉辫;
受取検体の条件について
1)冻结细胞
?1チューブあたり细胞1×105个以上、融解后の细胞生存率が80%以上で、凝集しないこと。
?1検体あたり3チューブ以上(解析用チューブ、予备チューブ、融解テスト用チューブ)をご提供ください。
?冻结方法は、こちらの「冻结细胞の调製、融解、送付について」をご覧ください。
?申し込み前に、融解后の细胞生存率および细胞が凝集しないことを必ず确认してください。
２)生细胞(横浜市立大学内研究者のみ)
?1検体あたり细胞5×104个以上、细胞生存率が80%以上で、凝集しないこと。
?生细胞の解析を希望される场合は、受注确定后に担当者から日程调整の连络をいたします。
?申し込み前に、细胞悬浊液调製后の细胞生存率と细胞が凝集しないことを必ず确认してください。
ライブラリー调製、シーケンス
?ライブラリー调製キット:10X Genomics社Chromium Next GEM Single Cell 3’ Kit v3.1
?シーケンス:イルミナ社 NextSeq 500によるシーケンス、または外注
データ解析?提供
?ソフトウェア:10X Genomics社Cell Ranger()
?リファレンス配列:hg38(ヒト)、mm10(マウス)
?纳品物:リード情报(FASTQ)、遗伝子発现量データ(Cell rangerデータ)
?データ提供方法:USBメモリ、またはハードディクスにて提供
支払いが可能な研究费(横浜市立大学内研究者のみ)
?科学研究费、奨学寄附金(民间财団の研究助成金など)、民间の受託研究?共同研究费、基础研究费、かもめプロジェクト助成金、戦略的学术研究推进费
※学外からの利用者の方には、受注确定后に见积书をお送りします。その后、解析完了后に纳品书と请求书を発行いたします。
その他の注意事项
?当受託解析は本拠点との共同研究となります。
?ヒトならびにマウス検体ともに、文部科学省の「遗伝子组换え生物等の使用等の规制による生物の多様性の确保に関する法律」(カルタヘナ法)におけるP1またはP2レベルの検体に限ります。
&濒迟;ヒト生体试料の申込について>
ヒト生体由来の検体は伦理委员会等で遗伝子解析研究に用いることの承认を受けた上で行うこととし、かつ委託者の责任において匿名化されたものに限らせていただきます。本拠点では、试料を适切に管理した上で解析を行い、本解析内容を超えた利用は行いません。また、解析委託を受けた者以外へ検体や、业务上知り得た情报を、提供いたしません。
<マウス生体试料の申込について>
ご所属の研究机関の动物実験委员会にて动物実験の承认を受けた上で行うこととします。&苍产蝉辫;
<受注后のキャンセルについて&驳迟;
解析受注后、実作业に入ってからのキャンセルはお受けできません。検体受领后の细胞融解やクオリティチェックで问题が见つかった场合など、検体に问题がある场合にはご连络いたします。もし解析を取りやめる场合は、実作业分の费用を负担していただきます。またクオリティが十分でない検体のシーケンスを行う场合には、データ量や质が想定値に达しない场合があることを、ご了承ください。その他、解析中に不测の事态が生じた场合にもご连络いたします。
&濒迟;検体の受け渡し&驳迟;
受注确定后、検体の受け渡しなどについて担当者から连络をいたします。その际に、検体の準备状况についてもお伺いいたします。
&濒迟;支払い&驳迟;
当拠点より请求书を発行いたしますので、指定期日までに支払いをお愿いいたします。料金の支払いは解析データ报告后となるため、科学研究费など研究期间に制限のある予算の场合にはご注意ください。支払い方法によっては、お引き受け出来ない场合もあります。
&濒迟;纳期&驳迟;
検体受け取り后、约１~2ヶ月を予定しています。受注时におおよその纳期をお知らせいたします。また解析が终了次第ご连络いたします。
&濒迟;検体?データの保存&驳迟;
ご提供いただいた検体情报や残存検体、ライブラリー调製过程で生成される関连试料、シーケンスデータなどは一定期间保管し、顺次适切に廃弃致します。返却を希望される场合には、事前にご相谈ください。
&濒迟;その他&驳迟;
申込内容に不備、又は虚偽の記載がある場合は、申込をお断りします 。
受託解析の利用について
こちらもお読みください。
解析の申込
?こちらのにご记入ください。
?送信后、担当者から折り返しご连络いたします。検体情报の记入用シートをお送りしますので、ご记入の上、返送をお愿いいたします。検体情报についての确认などが済み、次第となります。
お问い合わせ先