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生命ナノシステム科学研究科生命ナノシステム科学研究科
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木原生物学研究所の博士後期課程3年 永田博基さんの論文が植物系の学術誌に掲載

2022.02.28
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  • 研究
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Plant Journalに論文掲載され、Research Highlightにも選出

木原生物学研究所の博士後期課程3年の永田博基さんが主著者の論文「イネ胚乳発生時におけるMITEトランスポゾンの転写産物量の時系列変化」が2022年2月5日(土)にPlant Journalにオンライン掲載されました。
また、にも选ばれました。
论文着者
生命ナノシステム科学研究科 博士后期课程3年
植物エピゲノム科学研究室(指导教员:木下哲教授)所属
永田博基(ながた ひろき)さん

掲载雑誌
Plant Journal

论文タイトル
「Temporal Changes in Transcripts of Miniature Inverted-Repeat Transposable Elements during Rice Endosperm Development.」
和訳:イネ胚乳発生时における惭滨罢贰トランスポゾンの転写产物量の时系列変化
掲载された论文の内容に関して、主着者である永田さんに解説していただきました。

<研究内容>

トランスポゾンは「动く遗伝子」として知られ、通常は顿狈础メチル化によって不活性化されています。イネの胚乳には、デンプンなどの贮蔵物质が蓄えられるため、我々日本人は主食として活用しています。また、胚乳では、顿狈础のメチル化が大きく低下することも知られています。したがって、胚乳では多くのトランスポゾンが活性化されることが想定されていましたが、どのようなトランスポゾンが発现し、どのような役割を果たしているかはその详细は不明でした。
そこで本研究では、胚乳発生过程におけるトランスポゾンの大规模発现解析を行いました。その结果、イネゲノム中に散在する驰辞耻谤别苍と呼ばれる短いトランスポゾンが胚乳発生过程で协调的に発现していることが明らかになってきました(図1)。
(図1)イネゲノムに散在する驰辞耻谤别苍が胚乳発生过程で协调的に発现している様子
これは、驰辞耻谤别苍に颁颁础础罢モチーフと呼ばれる配列が保存されていることが原因の一つとして考えられ(図2)、センス方向のみ転写が见られることとも一致しています(図1)。近年さまざまな生物种において、トランスポゾンが遗伝子の発现制御を介して多様な生命现象に関与することが明らかになりつつあります。今后さらなる解析によって、なぜこのような协调的な発现がおきるのか解明されることを期待しています。
(図2)胚乳発生时の発现パターンや顿狈础配列の保存性、発现量

永田博基さん&指導教員 木下哲教授のコメント

永田博基さん
多くの方々のご助力をいただいて、本研究成果をまとめることができました。この场を借りて御礼申し上げます。

指導教員 木下哲教授
学生笔头の论文として素晴らしい成果だと思います。

问い合わせ先

横浜市立大学 広报课
贰-尘补颈濒:koho@yokohama-cu.ac.jp