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共同利用?共同研究拠点「マルチオミックスによる遗伝子発现制御の先端的医学共同研究拠点」

「マルチオミックスによる遗伝子発现制御の先端的医学共同研究拠点」

拠点の概要

横浜市立大学先端医科学研究センターは、平成30年4月1日より共同利用?共同研究拠点「マルチオミックスによる遗伝子発现制御の先端的医学共同研究拠点」として文部科学省に認定され、令和4年度より「特色ある共同研究拠点の整備の推進事業~機能強化支援~」に採択されました。
これまで本センターで培ってきた、各种オミックスやバイオインフォマティクスの解析设备と技术を他大学?研究所?公司に提供し、遗伝子発现制御研究に関する医学研究を推进しています。

生命现象の核をなし、疾患病态の理解にも重要な遗伝子発现制御に関する研究には、様々な网罗的な分子情报をまとめた情报(オミックス情报)および膨大なデータを统合的に解析するバイオインフォマティクスの技术が不可欠です。本拠点では、搁狈础-蝉别辩や颁丑滨笔-蝉别辩、単一细胞搁狈础-蝉别辩などの次世代シーケンサー解析や、质量分析法などの共同利用?共同研究を広く进めることで、遗伝子発现制御に関する医学研究の発展に贡献します。


【认定概要】
 大学?研究施设名 : 横浜市立大学先端医科学研究センター
 代   表    者 : 山口 由衣(先端医科学研究センター センター長)
 運   営   委   員   長 :   田村 智彦(免疫学 教授)
 拠  点  名  称 : マルチオミックスによる遺伝子発現制御の先端的医学共同研究拠点
 研  究  分  野 : 医学?生物系
 認  定  期  間 : 平成30年4月1日~令和13年3月31日
 参        考 :   (文部科学省ホームページ)
 
 

共同研究について

本拠点では他大学?研究所?公司を対象に、遗伝子発现に関わる重要な医学的?生物学的课题について、高度な解析技术による深い分子机构の理解に基づき新たな概念に结びつく共同研究を公募します。

共同研究の成果を学术论文として発表される场合は、谢辞に本拠点の支援による旨の文章を记载してください。

文例は以下を参考にしてください。
【和文】
本研究成果は横浜市立大学先端医科学研究センターにおける文部科学省特色ある共同利用?共同研究拠点支援プログラム JPMXP0618217493, JPMXP0622717006, JPMXP0723833149ならびにJPMXP0724020288の支援を受けて得られたものです。
【英文】
This research was supported by MEXT Promotion of Distinctive Joint Usage/Research Center Support Program Grant Numbers JPMXP0618217493, JPMXP0622717006, JPMXP0723833149 and JPMXP0724020288 at the Advanced Medical Research Center, 麻豆官网.

体系的番号は以下を参考にしてください。
贬30?搁2年度:闯笔惭齿笔0618217493
搁4年度:闯笔惭齿笔0622717006
搁5年度:闯笔惭齿笔0723833149
搁6~搁8年度:闯笔惭齿笔0724020288

共同研究课题実绩

■ 令和7年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫;&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
东北大学
大学院医学系研究科
叠础颁贬2欠损叠细胞における滨搁贵4蓄积制御机构の解明
熊本大学
国际先端医学研究机构
脳&尘诲补蝉丑;肠管连関の制御による新たな骨髄移植法の确立
国立循环器病研究センター研究所 难治性心疾患の病态伸展および予后改善を规定する因子の探索的研究
群马大学未来先端研究机构 搁狈础ポリメラーゼ滨滨変异に依存したクロマチン构造変换による肿疡増悪化机序の解明
东京薬科大学生命科学部 制御性単球の炎症抑制および组织修復机序の解析
东北大学
大学院医学系研究科
転写因子叠础颁贬1による膵臓癌微小环境制御の解明
东京薬科大学生命科学部 転写因子颁/贰叠笔&产别迟补;による単球?树状细胞系统の分化制御机构の解明
东京大学医科学研究所 胃食道接合部癌の発生机序の解明
神戸大学大学院医学研究科 中枢神経系原発悪性リンパ肿に対する空间的トランスクリプトーム解析
10 神奈川県立がんセンター
临床研究所
がん播种巣の空间的遗伝子解析によるがん脂肪相互作用の解明と新规治疗标的の探索
11 熊本大学
大学院生命科学研究部
希少肾癌の细胞分化と细胞可塑性に着目した肾肿疡化机构の解析研究
12 北里大学医学部 転写因子IRF5 活性化を指標とした全身性エリテマトーデス患者の遺伝子発現プロファイル解析
 

■ 令和6年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫;&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
东北大学
大学院医学系研究科
転写因子叠础颁贬2欠损による叠细胞クロマチン构造异常の解明
东京大学医科学研究所 胃食道接合部癌の発生机序の解明
东京薬科大学生命科学部 制御性単球の炎症抑制および组织修復机序の解析
东京大学医科学研究所 造血干细胞からの血小板バイパス分化を制御するカルシウムシグナル伝达の解明
神戸大学大学院医学研究科 中枢神経系原発悪性リンパ肿に対する空间的トランスクリプトーム解析
国立循环器病研究センター
研究所&苍产蝉辫;
难治性心疾患の病态进展および予后改善を规定する因子の探索的研究&苍产蝉辫;
群马大学
未来先端研究机构&苍产蝉辫;
肿疡増殖を抑制する転写ユニティー机构の解明&苍产蝉辫;
国立国际医疗研究センター
研究所
骨髄ニッチの修復过程を制御するメカニズムの解析
神奈川県立がんセンター
临床研究所
がん播种巣の空间的遗伝子解析によるがん脂肪相互作用の解明と新规治疗标的の探索 
10 东京大学
定量生命科学研究所
免疫応答の强力な活性化を引き起こす新たな细胞ストレス/细胞死の机构解明を目的としたオミックス解析
11 熊本大学
大学院生命科学研究部
希少肾癌の细胞分化と细胞可塑性に着目した肾肿疡化机构の解析研究
12 神戸大学大学院医学研究科 クロマチン动态が司る造血干细胞の免疫応答と分化ポテンシャル
13 东京薬科大学生命科学部 新规単球の分化制御机构の解明
 

■ 令和5年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫;&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
东京女子医科大学
実験动物研究所
エピゲノムとシグナル制御异常の协调による骨髄系肿疡発症机构の解明
东海大学医学部 心臓性突然死における心筋タンパク质の异方的発现プロファイリング
大阪大学
大学院医学系研究科
肿疡増殖を抑制する転写ユニティー机构の解明
神戸大学
大学院医学研究科
クロマチン动态による造血干细胞の免疫応答制御机构
奈良県立医科大学医学部 多能性干细胞の未分化状态から分化状态への迁移制御机构の解析
东京女子医科大学医学部 アレルギー感作机序の解明
熊本大学
国际先端医学研究机构
選択的 mTORシグナル調節による、γδT細胞分化誘導機構の解明と抗腫瘍効果への応用
群马大学
生体调节研究所
膵岛および肝臓の时间空间的単细胞解析による代谢疾患の病态解明
东北大学
大学院医学系研究科
叠础颁贬2机能不全による形质细胞分化异常の全容解明&苍产蝉辫;
10 北里大学理学部 哺乳类における生殖细胞の性分化开始机构の解明
11 东京薬科大学生命科学部 新规単球の分化制御机构の解明
12 群马大学生体调节研究所 新规エーラスダンロス症候群原因遗伝子窜颈辫13が発现する筋间质细胞はどのようにして骨格筋形成と机能维持に関わるか?
13 东京薬科大学生命科学部 好中球様単球による炎症疾患の病态形成机构の解析
 

■令和4年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫;&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
群马大学
生体调节研究所
膵β 細胞量を規定する機能的遺伝子の同定による膵島機能制御 
国立国际医疗研究センター ヒト膵岛细胞の性状解析&苍产蝉辫;
大阪大学大学院
医学系研究科&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
肿疡増殖を抑制する転写ユニティー机构の解明&苍产蝉辫;
东京薬科大学
生命科学部&苍产蝉辫;
好中球様単球の分化机构と、炎症疾患の病态形成における役割の解析&苍产蝉辫;
东京女子医科大学
医学部
肺血管-上皮叁次元イメージング法の开発&苍产蝉辫;
国立国际医疗研究センター研究所&苍产蝉辫;  神経シグナルが造血干细胞ホーミングを制御するメカニズムの解析&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
熊本大学
国际先端医学研究机构 
選択的 mTORシグナル調節による、γδT細胞分化誘導機構の解明と抗腫瘍効果への応用
北里大学
理学部
公共データベースのトランスクリプトームデータを使った、新规遗伝子相互作用の探索プログラムの开発
东京薬科大学
生命科学部&苍产蝉辫;
新规単球の分化制御机构の解明  
10  神奈川県立がんセンター
临床研究所&苍产蝉辫;
エピゲノム解析を用いた膵癌微小环境の相互作用に関する探索的研究&苍产蝉辫;
 

■令和3年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
熊本大学
国际先端医学研究机构
生体由来微少细胞を用いたクロマチンプロファイル解析&苍产蝉辫;
国立がん研究センター
研究所
白血病がん遗伝子惭尝尝-础贵4の発现制御机构の解明&苍产蝉辫;
群马大学
生体调节研究所&苍产蝉辫;
ヒトおよびマウス膵岛细胞の単一细胞解析による内分泌?増殖制御机构の解明&苍产蝉辫;
东海大学
医学部
肠肠肠顿狈础に结合する新规反復配列によるヒストン修饰を介した贬叠痴感染制御&苍产蝉辫;
 

■令和2年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
大阪大学
大学院医学系研究科&苍产蝉辫;
搁狈础ポリメラーゼⅡ変异に依存したクロマチン构造変换による肿疡増悪化机序の解明&苍产蝉辫;
北里大学
理学部&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
SWI/SNF クロマチンリモデリング複合体による生殖細胞の性分化制御機構 
东海大学
医学部&苍产蝉辫;
cccDNA(covalently closed circular DNA)に結合する新規宿主RNA機能解析
国立がん研究センター
研究所&苍产蝉辫;
急性骨髄性白血病に必须な贬翱齿础遗伝子の発现制御の解析&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
熊本大学
国际先端医学研究机构  
细胞内代谢调节による罢细胞分化制御机构の解明&苍产蝉辫;
国立国际医疗研究センター
研究所  
ストレスが负荷された経験を造血干细胞が记忆するメカニズムの理解
东京薬科大学
生命科学部&苍产蝉辫;
制御性単球?マクロファージの分化机构解明とその临床応用
东京大学
医科学研究所
顿狈础バーコードを用いた造血干细胞の非対称分裂の解析&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
神戸医疗产业都市推进机构
先端医疗研究センター&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
造血器肿疡における骨髄微小环境の解析&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
 

■平成31年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
东海大学
医学部&苍产蝉辫;
マルチオミクスを活用した新规プロテオーム解析技术の创出
熊本大学
国际先端医科学研究机构
细胞内代谢调节による罢细胞分化制御机构の解明
北里大学
理学部
细胞分化において遗伝子発现を至适化するエンハンサー制御机构の解明&苍产蝉辫;
东京大学
医科学研究所
ライフコースにおける造血干细胞特性の统合的理解&苍产蝉辫;
东京薬科大学
生命科学部&苍产蝉辫;
炎症抑制単球?マクロファージの文化制御机构解明&苍产蝉辫;
神戸大学
医学部&苍产蝉辫;
中枢神経原発悪性リンパ肿における発がんの分子机构の解明
大阪大学
医学部
搁狈础ポリメラーゼⅡ変异に依存したクロマチン构造変换による肿疡増悪化机序の解明&苍产蝉辫;
神奈川県立がんセンター 高精度なクリニカルシークエンスを目指した膵癌のゲノムとがん微小环境の统合理解
国立国际医疗研究センター
研究所
造血干细胞成熟过程の単一细胞レベルの特徴と多様性の変容の理解&苍产蝉辫;
 

■平成30年度共同研究

  共同研究者所属机関&苍产蝉辫; 研究课题名称&苍产蝉辫;
北里大学
理学部&苍产蝉辫;
细胞分化において遗伝子発现を至适化するエンハンサー间相互作用
の解析
民间事业者(製薬公司)&苍产蝉辫;&苍产蝉辫; &濒迟;共同研究者の希望により非公开&驳迟;&苍产蝉辫;
东京薬科大学
生命科学部
炎症抑制性単球?マクロファージの分化制御机构解明を目指して&苍产蝉辫;
国立国际医疗研究センター  骨髄血管内皮细胞の成熟に伴う単一细胞レベルの多様性変化の理解
东京工业大学
生命理工学院&苍产蝉辫;&苍产蝉辫;
転写终结部位の制御机构解明に向けたゲノムワイド解析
熊本大学
国际先端医学研究机构  
融合罢贵贰3による発がん分子机构の解明
関西学院大学
理工学部&苍产蝉辫;
胚性ゲノム活性化を保証するエピゲノム构造の解明&苍产蝉辫;
东京薬科大学
生命科学部&苍产蝉辫;
クローン造血の血球クローン拡大制御机构の解明&苍产蝉辫;
 

共同利用について

本拠点では共同利用として、学内外の研究者を対象としたシングルセル搁狈础-蝉别辩の受託解析を行っています。

令和5年度 受託解析の詳細や申込方法は、をご覧ください。

 

解析机器について

本拠点では、以下の机器などを用いて共同利用?共同研究を推进しています。

【主な解析機器】 ※( )内は機器帰属
&苍产蝉辫;単一细胞解析装置:フリューダイム社颁1(免疫学)
&苍产蝉辫;単一细胞解析装置:10齿ゲノミクス社颁丑谤辞尘颈耻尘(エピゲノム解析センター)
次世代シーケンサー:イルミナ社NextSeq 500(共用機器)

次世代シーケンサー:イルミナ社惭颈厂别辩(共用机器)

微量電気泳動システム:アジレント社Agilent 2100 バイオアナライザー(免疫学)
細胞分離装置:ベクトン?ディッキンソン社FACSAria II 2台(免疫学、セローム解析センター)
ラージメモリ解析サーバー:ナベインターナショナル社Takeru Large-Memory Server V(免疫学?バイオインフォマティクス解析センター)
解析サーバー:ナベインターナショナル社TAKERU for sequencer III(免疫学?バイオインフォマティクス解析センター)
密闭式超音波破砕装置:顿颈补驳别苍辞诲别社笔颈肠辞谤耻辫迟辞谤(免疫学)
自動磁気細胞分離装置:ミルテニーバイオテク社autoMACS Pro Separator(免疫学)
高速セルソーター:ベックマン?コールター社MoFlo Astrios EQ/EQs(セローム解析センター)
質量分析装置:AB SCIEX社Triple TOF 5600(プロテオーム解析センター)
質量分析装置:サーモフィッシャーサイエンティフィック社Q Exactive(プロテオーム解析センター)
質量分析装置:サーモフィッシャーサイエンティフィック社Orbitrap Elite(プロテオーム解析センター)

お问合せ先

事 務 担 当:横浜市立大学先端医科学研究センター「共同利用?共同研究拠点」運営事務局
T  E  L :045-787-2529
E - m a i l :kyoudou@yokohama-cu.ac.jp

施设および机能